В отличии от НДФЛа уплата Страховых взносов не может фиксироваться вместе с выплатой автоматически - на то есть спец. документ "Уплата страховых взносов в фонды" - "взаиморасчеты" ведутся в рамках регистра "Расчеты с фондами по страховым взносам" - начислением ЗП делается приход, Уплатой взносов расход.
Обратная ситуация наблюдается начислением пособий за счет ФСС - расход формируется документами "Единовременное пособие", "Больничный лист", а приход "закрываются" - "Получение возмещения пособий от ФСС"