Как можно добиться результата иначе???
Смотря какой результат нужен. Раз надо исключить перемещение, а оно между складами, значит, чтобы арифметика сошлась, надо делать сводный отчет по предприятию / организации, для которого данные движения являются внутренними.
Если всё же надо делать в разрезе складов, то следует понимать, что перемещения для каждого склада являются по сути приходом или расходом, причем приход и расход в общем случае по суммам различны, следовательно, их удаление арифметику нарушит. Как вариант - арифметику в разрезе складов вообще не контролировать, если такое в данном случае вообще допустимо.